Natürliche endogene Fluorophore, wie NADH/NADPH, Flavine, Nukleotide (ATP, GTP), Nukleinsäuren (DNA, RNA) können als Leitsubstanzen für den Stoffwechselzustand eines Organismus dienen. (Quelle: bmb+f Forschungslandkarte Deutschland 1998)
Chromophore können Carotinoide oder Flavine (Vitamin-B-ähnliche Moleküle) sein. (Quelle: Spektrum der Wissenschaft 1998)